Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y73

UPF0722 protein C11orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q80Y73 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q80Y73 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q80Y73 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q80Y73 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q80Y73 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q80Y73 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q80Y73 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q80Y73 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q80Y73 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q80Y73 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q80Y73 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q80Y73 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q80Y73 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q80Y73 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q80Y73 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q80Y73 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q80Y73 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q80Y73 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q80Y73 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q80Y73 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q80Y73 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q80Y73 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q80Y73 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q80Y73 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q80Y73 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q80Y73 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q80Y73 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q80Y73 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q80Y73 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q80Y73 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q80Y73 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q80Y73 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q80Y73 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q80Y73 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q80Y73 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q80Y73 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q80Y73 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q80Y73 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q80Y73 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q80Y73 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q80Y73 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q80Y73 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q80Y73 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q80Y73 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q80Y73 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q80Y73 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q80Y73 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q80Y73 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q80Y73 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q80Y73 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q80Y73 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q80Y73 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q80Y73 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q80Y73 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q80Y73 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Q80Y73 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q80Y73 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q80Y73 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q80Y73 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q80Y73 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q80Y73 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q80Y73 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q80Y73 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q80Y73 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q80Y73 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q80Y73 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q80Y73 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q80Y73 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q80Y73 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q80Y73 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q80Y73 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q80Y73 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q80Y73 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q80Y73 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q80Y73 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q80Y73 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q80Y73 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q80Y73 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q80Y73 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q80Y73 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q80Y73 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q80Y73 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q80Y73 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q80Y73 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q80Y73 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q80Y73 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q80Y73 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q80Y73 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q80Y73 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q80Y73 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q80Y73 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q80Y73 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q80Y73 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q80Y73 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q80Y73 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q80Y73 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q80Y73 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q80Y73 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q80Y73 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q80Y73 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms