Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap100Q80VN0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap100Q80VN0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap100Q80VN0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap100Q80VN0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap100Q80VN0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap100Q80VN0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap100Q80VN0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap100Q80VN0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap100Q80VN0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap100Q80VN0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap100Q80VN0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap100Q80VN0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap100Q80VN0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap100Q80VN0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cfap100Q80VN0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap100Q80VN0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap100Q80VN0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap100Q80VN0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap100Q80VN0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap100Q80VN0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap100Q80VN0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap100Q80VN0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap100Q80VN0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap100Q80VN0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap100Q80VN0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap100Q80VN0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap100Q80VN0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cfap100Q80VN0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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