Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z494

NPHP3, Nephrocystin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3Q7Z494 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPHP3Q7Z494 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPHP3Q7Z494 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPHP3Q7Z494 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPHP3Q7Z494 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPHP3Q7Z494 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPHP3Q7Z494 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NPHP3Q7Z494 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPHP3Q7Z494 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPHP3Q7Z494 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPHP3Q7Z494 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NPHP3Q7Z494 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPHP3Q7Z494 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPHP3Q7Z494 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPHP3Q7Z494 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPHP3Q7Z494 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPHP3Q7Z494 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NPHP3Q7Z494 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NPHP3Q7Z494 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NPHP3Q7Z494 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
NPHP3Q7Z494 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPHP3Q7Z494 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms