Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgo2Q7TSY8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2Q7TSY8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms