Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc6aQ78XR0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms