Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vma21Q78T54 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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