Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Eci3Q78JN3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Eci3Q78JN3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Eci3Q78JN3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Eci3Q78JN3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Eci3Q78JN3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Eci3Q78JN3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Eci3Q78JN3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Eci3Q78JN3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Eci3Q78JN3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Eci3Q78JN3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Eci3Q78JN3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Eci3Q78JN3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eci3Q78JN3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms