Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NinlQ6ZQ12 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NinlQ6ZQ12 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NinlQ6ZQ12 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NinlQ6ZQ12 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NinlQ6ZQ12 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NinlQ6ZQ12 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NinlQ6ZQ12 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NinlQ6ZQ12 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NinlQ6ZQ12 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NinlQ6ZQ12 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NinlQ6ZQ12 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NinlQ6ZQ12 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NinlQ6ZQ12 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NinlQ6ZQ12 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NinlQ6ZQ12 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NinlQ6ZQ12 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NinlQ6ZQ12 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NinlQ6ZQ12 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms