Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd4Q6ZPR5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms