Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Znf653Q6YND2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms