Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY52

Gm7247, Predicted gene 7247, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7247Q6UY52 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm7247Q6UY52 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms