Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms