Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff1Q6PFE7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms