Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbtb39Q6PDK0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbtb39Q6PDK0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbtb39Q6PDK0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbtb39Q6PDK0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbtb39Q6PDK0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbtb39Q6PDK0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbtb39Q6PDK0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms