Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp2d40Q6P8N9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms