Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrp12Q6P5B0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrp12Q6P5B0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms