Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXM2

Rcbtb1, RCC1 and BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb1Q6NXM2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcbtb1Q6NXM2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms