Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Wdr44Q6NVE8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Wdr44Q6NVE8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms