Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cep78Q6IRU7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms