Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ParpbpQ6IRT3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ParpbpQ6IRT3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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