Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQU0

UPF0524 protein C3orf70 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6GQU0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q6GQU0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Q6GQU0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q6GQU0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6GQU0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6GQU0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6GQU0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6GQU0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6GQU0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6GQU0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms