Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rftn1Q6A0D4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms