Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
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Sbno1Q689Z5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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Sbno1Q689Z5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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Sbno1Q689Z5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sbno1Q689Z5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms