Protein–RNA interactions for Protein: Q640P7

Tbccd1, TBCC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbccd1Q640P7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tbccd1Q640P7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tbccd1Q640P7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbccd1Q640P7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tbccd1Q640P7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tbccd1Q640P7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tbccd1Q640P7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbccd1Q640P7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbccd1Q640P7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbccd1Q640P7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbccd1Q640P7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbccd1Q640P7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbccd1Q640P7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbccd1Q640P7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbccd1Q640P7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbccd1Q640P7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbccd1Q640P7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbccd1Q640P7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbccd1Q640P7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbccd1Q640P7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbccd1Q640P7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbccd1Q640P7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbccd1Q640P7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbccd1Q640P7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbccd1Q640P7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbccd1Q640P7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbccd1Q640P7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbccd1Q640P7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbccd1Q640P7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbccd1Q640P7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbccd1Q640P7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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