Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms