Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ift52Q62559 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms