Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Vil1Q62468 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
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Vil1Q62468 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
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Vil1Q62468 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
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Vil1Q62468 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vil1Q62468 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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