Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Kdm5dQ62240 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Kdm5dQ62240 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Kdm5dQ62240 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Kdm5dQ62240 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Kdm5dQ62240 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Kdm5dQ62240 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Kdm5dQ62240 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Kdm5dQ62240 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Kdm5dQ62240 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Kdm5dQ62240 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Kdm5dQ62240 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Kdm5dQ62240 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Kdm5dQ62240 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Kdm5dQ62240 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Kdm5dQ62240 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Kdm5dQ62240 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Kdm5dQ62240 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Kdm5dQ62240 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Kdm5dQ62240 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Kdm5dQ62240 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Kdm5dQ62240 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Kdm5dQ62240 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Kdm5dQ62240 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Kdm5dQ62240 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Kdm5dQ62240 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms