Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sycp1Q62209 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms