Protein–RNA interactions for Protein: Q62178

Sema4a, Semaphorin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4aQ62178 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms