Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg1aQ61495 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms