Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms