Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Usf1Q61069 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Usf1Q61069 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Usf1Q61069 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usf1Q61069 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usf1Q61069 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usf1Q61069 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usf1Q61069 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Usf1Q61069 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usf1Q61069 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usf1Q61069 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Usf1Q61069 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usf1Q61069 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usf1Q61069 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usf1Q61069 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usf1Q61069 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usf1Q61069 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usf1Q61069 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usf1Q61069 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usf1Q61069 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usf1Q61069 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usf1Q61069 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Usf1Q61069 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Usf1Q61069 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usf1Q61069 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usf1Q61069 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usf1Q61069 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usf1Q61069 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usf1Q61069 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usf1Q61069 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usf1Q61069 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usf1Q61069 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usf1Q61069 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usf1Q61069 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usf1Q61069 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usf1Q61069 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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