Protein–RNA interactions for Protein: Q61045

Sim1, Single-minded homolog 1, mousemouse

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim1Q61045 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Sim1Q61045 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sim1Q61045 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Sim1Q61045 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Sim1Q61045 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sim1Q61045 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sim1Q61045 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sim1Q61045 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Sim1Q61045 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sim1Q61045 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sim1Q61045 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Sim1Q61045 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Sim1Q61045 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sim1Q61045 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sim1Q61045 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sim1Q61045 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sim1Q61045 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sim1Q61045 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sim1Q61045 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sim1Q61045 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sim1Q61045 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sim1Q61045 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sim1Q61045 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sim1Q61045 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sim1Q61045 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sim1Q61045 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sim1Q61045 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sim1Q61045 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sim1Q61045 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sim1Q61045 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sim1Q61045 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sim1Q61045 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sim1Q61045 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sim1Q61045 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sim1Q61045 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sim1Q61045 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sim1Q61045 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sim1Q61045 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sim1Q61045 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sim1Q61045 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms