Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Traf3Q60803 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms