Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm1Q60636 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms