Protein–RNA interactions for Protein: Q60604

Scin, Adseverin, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScinQ60604 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScinQ60604 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScinQ60604 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScinQ60604 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScinQ60604 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScinQ60604 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScinQ60604 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ScinQ60604 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ScinQ60604 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ScinQ60604 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ScinQ60604 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScinQ60604 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScinQ60604 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms