Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf3Q5HZG4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms