Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prkaa1Q5EG47 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms