Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms