Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtl5Q5DTT4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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Rtl5Q5DTT4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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Rtl5Q5DTT4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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Rtl5Q5DTT4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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Rtl5Q5DTT4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
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