Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa20Q45VN2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms