Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnah12Q3V0Q1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms