Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0I2

Prr7, Proline-rich protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr7Q3V0I2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prr7Q3V0I2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms