Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms