Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpr55Q3UJF0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms