Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nom1Q3UFM5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms