Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U6N9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U6N9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U6N9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U6N9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U6N9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U6N9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U6N9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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