Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U595 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U595 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U595 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U595 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U595 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U595 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U595 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U595 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U595 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U595 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U595 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U595 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U595 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U595 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U595 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U595 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U595 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U595 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U595 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U595 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U595 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U595 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U595 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U595 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U595 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U595 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U595 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U595 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U595 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U595 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U595 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U595 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U595 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U595 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U595 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U595 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q3U595 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U595 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U595 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U595 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U595 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U595 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U595 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U595 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U595 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U595 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U595 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U595 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U595 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U595 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U595 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U595 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U595 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U595 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U595 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U595 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U595 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U595 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U595 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U595 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U595 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U595 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U595 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U595 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U595 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U595 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U595 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U595 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U595 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U595 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U595 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U595 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U595 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U595 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U595 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U595 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U595 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U595 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U595 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U595 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U595 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U595 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U595 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U595 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U595 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U595 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U595 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U595 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U595 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U595 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U595 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U595 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U595 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U595 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U595 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U595 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U595 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U595 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U595 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms