Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gse1Q3U3C9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gse1Q3U3C9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms